Отац Харитон је киднапован 15. јуна 1999. године. Отац Харитон је био монах манастира Светих Архангела код Призрена.

Након више од годину дана трагања за њим, Комисија за ексхумацију несталих и киднапованих Срба пронашла је измасакрирано и обезглављено тело монаха Харитона, 8. августа 2000. године, у необележеном гробу, на гробљу албанског села Тусус, код Призрена.

Према извештају вештака, глава је одсечена оштрим предметом, поломљена му је кичма, неколико ребара и кости леве руке, а недостаје и неколико кичмених пршљенова. Тело је нађено у његовој монашкој мантији и џемперу, а уз њега су истражитељи пронашли и његову личну карту и бројаницу. Утврђено је да су му прслук и џемпер расечени са предње стране и у пределу срца, што је указивало на то да је оцу Харитону стомак био распорен и да је избоден ножем у пределу срца. Након масакра који је над мучеником Харитоном ивршен, одсечена му је глава. Глава монаха Харитона још увек није нађена. Недалеко од његовог тела пронађена су и тела неколико Срба пострадалих у исто време.

Продукција Радио Гораждевца је пре неколико година снимила кратку причу о једина два нестала свештена лица на просторима читаве бивше Југославије, оцу Харитону и оцу Стефану.

Прва фреска оца Харитона осликана је у манастиру Светих Архангела у Призрену, где је приказан са главом у руци.